美國疾病控制與預防中心（CDC）發起了一個聯盟，啟動了一個全國測序實驗室網絡，這將加速SARS-CoV-2序列數據在公共領域的發布。 快速釋放開放型冠狀病毒序列數據將有助於指導 COVID-19 公共衛生應對措施，推動創新和發現，並加深對這一流行病和未來流行病的了解。
這個 用於公共衛生應急響應，流行病學和監視（SARS）的SARS-CoV-2測序 財團，這將大大擴展其使用範圍 全基因組測序（WGS） 的COVID-19病毒。 SPHERES將向公共衛生應對小組提供一致的實時序列數據，以調查全國的COVID-19病例和群。
這個新的財團將幫助他們更好地了解該病毒如何在全國及當地社區傳播。 反過來，更好的數據將幫助公共衛生官員中斷傳播鏈，預防新的疾病病例，並保護和挽救生命。
“美國是先進的快速基因組測序的世界領導者。 我們的公共，私人，臨床和學術公共衛生實驗室之間的協調努力將在理解SARS-CoV-2的傳播，進化和治療方面發揮至關重要的作用。 我相信，我們最優秀，最熟練的人才將共同努力，以幫助我們挽救今天和明天的生命。”疾病預防控制中心主任羅伯特·雷德菲爾德（MD）
跟踪COVID-19病毒的演變
基因組序列數據可以提供對SARS-CoV-2生物學的空前洞察力，SARS-CoV-19是引起COVID-XNUMX的病毒，並有助於確定流行病的變化格局。 通過對美國各地的病毒進行測序，疾病預防控制中心和其他公共衛生部門可以監視病毒的重要變化，並使用此信息來指導接觸者追踪，公共衛生緩解措施和感染控制策略。
SPHERES聯盟是一項雄心勃勃的工作，旨在在全國范圍內協調SARS-CoV-2基因組測序，將數十個較小的個體工作組織成一個單一的分佈式實驗室，機構和公司網絡。 該聯盟整合了40個州和地方公共衛生部門，幾個大型臨床實驗室以及遍布聯邦政府，學術界和私營部門的超過二十個合作機構的專業知識，技術和資源。
SPHERES將建立最佳做法和共識數據標準，加速開放數據共享，並建立資源和專業知識庫，以幫助將尖端技術帶入國家COVID-19應對方案。
SPHERES數據已打開，共享
聯盟成員共同致力於快速開放序列共享。 他們計劃將所有有用的序列數據提交到國家醫學圖書館國家生物技術信息中心（NLM / NCBI），全球禽流感數據共享倡議（GISAID）以及其他公共序列存儲庫的公共存儲庫中。 這將有助於確保來自美國各地的病毒序列數據可快速用於公共衛生決策，並可供世界各地的研究人員免費使用。
財團成員包括：
聯邦機構和實驗室
先進的分子檢測辦公室疾病控制與預防中心
阿貢國家實驗室
國防衛生局 全球傳染性 疾病 監控
食品和藥物管理局
勞倫斯伯克利國家實驗室
洛斯阿拉莫斯國家實驗室
國立過敏與傳染病研究所，基因組與先進技術辦公室
國家標準與技術研究所
國家醫學圖書館國家生物技術信息中心
沃爾特里德陸軍研究所
州/地方公共衛生實驗室
亞利桑那
加利福尼亞州
特拉華
哥倫比亞特區
佛羅里達
夏威夷
緬因州
馬里蘭
馬薩諸塞
密歇根州
明尼蘇達
北卡羅來納
北達科他州
內華達
新墨西哥
紐約
猶他州
弗吉尼亞州
華盛頓
威斯康星
懷俄明
學術機構
貝勒大學
美國康奈爾大學
弗雷德·哈欽森癌症研究中心
西奈山醫學院
紐約大學（New York University）
北亞利桑那大學
布法羅大學
美國加州大學伯克利分校
加利福尼亞大學戴維斯分校
美國加州大學歐文分校
美國加州大學洛杉磯
加利福尼亞州，舊金山大學
加州大學聖克魯斯分校
芝加哥大學
美國馬里蘭大學
美國明尼蘇達大學
內布拉斯加大學
新墨西哥大學
華盛頓大學
耶魯大學
企業
雅培診斷
生物梅里埃
顏色基因組學
銀杏生物工廠
DNA鑑定
Q電話
實驗室公司
一本法典
牛津納米孔技術
太平洋生物科學
卡根
任務診斷
生命科學
公司名稱僅供參考，此處所包含的名稱並不表示美國疾病控制與預防中心對公司或其任何商業產品或服務的認可。
非營利性公共衛生或研究機構
公共衛生實驗室協會
比爾和梅林達·蓋茨基金會
博德研究所
陳扎克伯格生物中心
克雷格·文特學院
公共衛生基因組流行病學聯盟
斯克里普斯研究
傑克遜實驗室
北方轉化基因組學研究所
沃爾德基金會
在過去的六年中，疾病預防控制中心的先進分子檢測辦公室計劃已在聯邦和州公共衛生實驗室進行了投資，以擴大病原體基因組學和其他先進實驗室技術在傳染病監測和暴發應對中的應用。 當前的財團投資旨在挽救SARS-CoV-2大流行中的生命，並為美國和世界做好應對未來大流行的準備。
要了解有關基因組測序或CDC在先進分子檢測中的工作的更多信息，請訪問 https://www.cdc.gov/amd/
